يتولَّى المجلس الأكاديمي في جامعة نزوى تنفيذَ السِّياساتِ المقرَّرة من قِبل مجلسِ الأمناء، ومتابعةَ الأمورِ الأكاديميَّةِ، ووضعَ اللَّوائحِ والخططِ والبرامج اللَّازمةِ لتحقيقِها. ويُعنى المجلس الأكاديميُّ بكافَّة الشؤون الأكاديميَّة في الجامعة. وهو يتكوَّن من رئيس الجامعة رئيسًا، وعضويَّة نواب الرَّئيس، ومساعد الرَّئيس لشؤون الطُّلاب، وعمداء الكليَّات، ومدير مكتبة الجامعة، وعضوين من هيئة التَّدريس منتخبين، وطالبٍ واحدٍ منتخب، إلى جانب عددٍ من الأكاديميِّين من جامعة السُّلطان قابوس؛ وذلك كجزءٍ من إستراتيجيَّة جامعة نزوى لجعل المجلس هيئةً إداريَّةً أكاديميَّة قويَّة.